Dalam rangka mewujudkan visi tersebut, ditetapkanlah 4 (empat) misi pembangunan Desa Penjalin Tahun 2023 - 2028 sebagai berikut :
Menyelenggarakan Pembangunan Sumber Daya Manusia yang beriman dan bertakwa kehadirat Allah SWT serta meningkatkan derajat kesehatan masyarakat dalam pembangunan yang berkelanjutan, Meningkatkan pertumbuhan perekonomian rakyat dengan mendorong secara sungguh-sungguh sentra perekonomian rakyat terutama pertanian,Usaha Mikro Kecil dan Menengah (UMKM), peternakan, perikanan, perdagangan dan jasa, lembaga keuangan, Infrastruktur serta Sosial budaya yang memadai.
Mewujudkan taraf hidup masyarakat yang sehat dalam meningkatkan kwalitas lingkungan yang bersih, sehat dan nyaman.
Good Gavernance yang Pemerintah desa menjadikan penyelengaraan pemerintahan yang efisien, efektif, bersih, demokratis, tepat, cepat dan bermanfaat dengan mengutamakan pelayanan kepada masyarakat melalui teknolongi 4.0. Memberdayakan Kelembagaan masyarakat sebagai subyek dan mitra pembangunan desa. Meningkatkan sumber daya manusia melelui Bimbingan Teknis dan pelatihan-pelatihan.
Meningkatkan kesadaran masyarakat untuk gemar bergotong-royong dan menjaga lingkungan dengan mengaktifkan siskamling.